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La información de los chats no puede ser monitoreada sí está cifrada de punto a punto, esto significa que los mensajes se encriptan en el emisor y se desencriptan en el receptor, por ende aunque Whatsapp quisiese revisar los mensajes de cada uno de sus usuarios, no podrían. Cuando se habla de los cambios de privacidad compartidos con Facebook (Que es de hecho la notificación) es por temas de Big Data, estos datos son cosas como: Nombre, edad, grupo étnico, país, amigos, gustos, religión, política, etc, se utilizan para enviar publicidad específica al mercado objetivo de cada marca. (Ejemplo: no le enviarás anuncios de hamburguesas a alguien vegetariano pero sí a alguien que vaya a eventos de comida rápida) y es ahí donde el big data tiene valor para la publicidad.
El enlace que publicaste a antena3 dice que los participantes habían publicado en facebook amenazas, ahí sí es un tema distinto, pues existe muchísima IA que se encarga de buscar entre todo el tráfico no encriptado palabras claves y generar alertas.